Ambientado 300 anos após os acontecimentos do aclamado Ghost of Tsushima, Ghost of Yōtei é uma experiência independente cujo pano de fundo é o Japão rural do século XVII. Na história, acompanhamos Atsu, uma mercenária solitária e atormentada pelo passado. Sedenta por vingança, ela percorre as belas e inóspitas paisagens do Japão setentrional à caça daqueles que, muitos anos antes, assassinaram a sua família.

Dezesseis anos após a morte dos familiares, Atsu se aventurará em regiões inexploradas de Ezo em busca da gangue de seis fora-da-lei, mas sua jornada acabará trazendo muito mais do que só vingança. 

No caminho, ela encontrará aliados inusitados e forjará elos que lhe darão uma nova razão para viver.